Fácil.
1. Abro un Terminal pulsando la combinación de teclas Alt+F2, escribiendo gnome-terminal (terminator o el emulador de consola que tengo instalado y uso) y haciendo clic con el botón izquierdo sobre el botón señalado con la palabra Ejecutar o presionando la tecla Intro.
2. Instalo el paquete xcompmgr con el siguiente comando (con el sudo delante si no es un Terminal de root y tengo sudo activado)
sudo aptitude install xcompmgr
3. Lo activo añadiéndolo a las aplicaciones que quiero que se arranquen al inicio de la sesión, y eso ya dependerá del escritorio o del gestor de ventanas que tenga instalado, ya que no es lo mismo hacerlo en Gnome que en Openbox, por poner un ejemplo.
Y pista.